Outils méthodologiques et base de données "Leishmaniose"
1. Contexte & historique
La Leishmaniose cutanée zoonotique (LCZ) constitue un problème de santé publique à l'échelle mondiale. Sa distribution géographique s'étale du Maroc jusqu'à l'Afghanistan et inclut tout le moyen orient. C'est une maladie zoonotique fortement influencée par des facteurs environnementaux (couvert végétal, pluviométrie, …) avec un cycle très complexe. Le réservoir est constitué par deux rongeurs : Psommomys obesus et Meriones shawi . Elle est transmise par un vecteur le phlébotome : Phlebotomus papatasi. Dans les pays du sud de la méditerranée, cette maladie constitue l'une des principales causes des déclarations obligatoires et occasionne une morbidité non négligeable avec des risques de flambées épidémiques saisonnières. La complexité du cycle de transmission, le caractère zoonotique, l'influence des facteurs environnementaux rendent la surveillance épidémiologique et la lutte extrêmement difficiles avec les outils de surveillance classiques. Pour cette raison, le sous projet EMPHIS-WP2 se propose de développer une nouvelle génération de système de surveillance qui intègre un suivi précis dans le temps et dans l'espace des cas de leishmaniose lorsqu'ils émergent par le biais d'un système d'informations géographique et par la transmission électronique des différents types de données de surveillance.
Ce système a été implémenté dans une zone pilote, dans deux pays de la région endémique (Tunisie et Jordanie) et se propose d'assurer un meilleur suivi de la dynamique de la LCZ. Dans le temps et l'espace pour une meilleure surveillance et contrôle.
Ce système se caractérise par :- L'intégration dans les structures de santé existante.
- L'utilisation des outils modernes de gestion d'information notamment
l'utilisation des système d'information géographique (SIG)
L'intégration a été assurée par la production d'un manuel des procédures décrivant l'organisation du SS et par une panoplie de programme de formation.
Le système informatique qui supporte ce SS est constitué de :
- Réseaux électronique qui relie la zone pilote (6 circonscriptions et une direction régionale à SidiBouzid, Sweimeh) avec deux institutions à Tunis (Direction des soins de santé de base et Institut Pasteur de Tunis) et au Ministère de la Santé de Jordanie (Amman)
- Ordinateurs : Desktop et serveurs
- GPSs pour le géoreferencement des objet d'intérêt (p..ex Cas de LCZ, Centre de Santé de Base)
- Une base de donnée qui contient les données reliées à la LCZ et au Systèmes de surveillance des deux pays.
- Une application qui permet l'entrée, validation, intégration,
traitement et exploitation des données.
2. Description de la méthode
Construction de la base
La structure de la base a été définie par les différents intervenants (épidémiologiste, mammologiste, entomologiste, responsable régionaux) dans le système de surveillance. Un ensemble de réunions et entrevues ont été conduites et ont abouti à définir les différents formulaires utilisés dans la collecte des différents types de données. C'est une base de donnée relationelle à plusieurs niveaux conçue avec un Système de Gestion de Bases de Données Relationelles (SGBDR) ( software : Oracle 9i)
Structure de la base
La Base de donnée contient essentiellement :
- Une table qui contient des informations concernant chaque cas le LCZ qui se présente à un centre de santé de base de la zone pilote. Ces informations concernent entre autres:
- les antécédents personnel et familiaux de lcz
- le diagnostic de la maladie
- le traitement des lésions
- Une table contenant la localisation géographique de chaque cas.
- Une table qui contient le résultat de capture de phlébotome (vecteur) dans 8 sites. Pour chaque site la capture est faite dans 3 biotopes différents (chambre à coucher, abris pour animaux, terrier de rongeur). Les résultats de capture sont constitués d'un inventaire des espèces de phlébotome capturés et si possible leur prévalence.
- Une table qui contient la position géographique de chaque site de piégeage.
- Une table contenant des informations relatives à la densité ainsi que la prévalence de rongeurs (réservoir) dans des zones représentatives. Les espèces de rongeurs suivies sont les psammomys et les mérions.
- Une table contenant la délimitation géographique des régions
représentées par les zones de surveillance.
3. Outils développés
- Le GPS : la prise de positions des différents évènements particulièrement les cas et leur intégration dans la base de donnée.
- Les applications pour la gestion des données textuelles et géographiques .
- Un Manuel des procédures qui standardise les questionnaires de recueil
de données et les méthodes de collecte, d'acheminement et de gestion de
l'information.
4. Utilisateurs
Deux groupes d'utilisateurs :
Les responsables des programmes de surveillance épidémiologiques des
deux pays (Jordanie et Tunisie) qui alimentent les bases de données et qui reçoivent une retro-information en temps réel sous forme d'indicateurs et de cartes de risques utiles pour mieux appréhender le problème de santé (leishmaniose).
Les chercheurs qui constituent un soutien technique pour le projet et les
utilisateurs des outils. Il développent les applications, préparent le
contenu des formations, assurent un accompagnement et participent à une
analyse poussée des données. Ces derniers sont multi- disciplinaires et
incluent des épidémiologistes (Tunisie, Jordanie), des ingénieurs
spécialisés en GIS et en gestion de données ((Grande Bretagne,
Tunisie, Jordanie) et en analyse poussée des données incluant la
modélisation mathématique (Tunisie, Gréce)
5. Résultats disponibles
- Cartes de risque décrivant la distribution spatiale de la maladie (leishmaniose) à plusieurs niveaux et son évolution dans le temps dans les zones pilotes des deux pays.
- Des indicateurs épidémiologiques en rapport avec la leishmaniose.
- Des illustrations de collecte de données sur le terrain utilisant
différents outils (GPS, rongeurs…)
Last modified 20-12-2005